علی ربیعی، سخنگوی دولت ایران در نشست خبری هفتگی خود در سیستان و بلوچستان به خبرنگاران گفت یکی از فرضیه‌ها در مورد انفجار نطنز دست داشتن «برخی از عناصر داخلی» است.
آقای ربیعی در باره این «عناصر داخلی» توضیح بیشتری ارایه نکرد اما تاکید کرد که «خرابکاری قطعی است.»
مقام‌های جمهوری اسلامی ایران تا کنون اظهار نظرهای مختلفی ارایه کرده‌اند ولی هنوز اطلاعات دقیقی از انفجار نطنز ارایه نداده‌اند.
این نخستین بار است که فرضیه دست داشتن عناصر داخلی از سوی مقامات ایران مطرح می‌شود.
کیوان خسروی، سخنگوی دبیرخانه شورای عالی امنیت ملی روز، جمعه ۱۳ تیر اعلام کرد دلیل انفجار تأسیسات هسته‌ای نظنز را «به صورت دقیق مشخص» کرده‌اند ولی به‌دلیل «ملاحظات امنیتی» فعلا اعلام نمی‌شود.
بهروز کمالوندی، سخنگوی سازمان انرژی اتمی ایران نیز روز یکشنبه دوم شهریور در مصاحبه با العالم، شبکه برون‌مرزی جمهوری اسلامی، بدون اشاره به جزییات انفجار تاسیسات هسته‌ای نطنز، گفت: «در نطنز انفجار خرابکارانه رخ داده است، اما جزئیات آن را مسئولین امنیتی در وقت مناسب اعلام خواهند کرد.»
جواد کریمی قدوسی، عضو کمیسیون امنیت ملی و سیاست خارجی مجلس ایران نیز روز چهارشنبه، اول مرداد در گفتگو با سایت «خانه ملت» پایگاه اینترنتی وابسته به مجلس ایران در مورد نتایج بررسی محل حادثه اعلام کرد: «گزینه رخنه در مسائل حراستی و حفاظتی جمع بندی قطعی ما است.»
اگر چه چند مقام جمهوری اسلامی «خرابکاری» و «رخنه در مسائل حراستی و حفاظتی» بودن این انفجار را اعلام کرده‌اند ولی گفته می‌شود نهادهای امنیتی جمهوری اسلامی تاکنون موفق به تشخیص دقیق چگونگی و منبع این انفجار نشده‌اند.
